本局表示，營利事業如有列報證券、期貨交易所得或合於獎勵規定之各項免稅所得時，應依所得基本稅額條例之相關規定計算、申報及繳納所得基本稅額。
本局指出，營利事業之基本所得額，為依所得稅法規定計算之課稅所得額，加計所得基本稅額條例第7條第1項各款規定免徵、免納或停止課徵營利事業所得稅之所得額後之合計數，並應依第8條規定計算基本稅額，當一般所得稅額低於基本稅額時，應按基本稅額繳納所得稅。
本局舉例說明，於查核轄內某公司103年度營利事業所得稅結算申報案件時，發現該公司列報出售國內上市股票之證券交易所得約3,000萬元，依所得稅法第4條之1規定證券交易所得停止課徵所得稅，當年度申報課稅所得為虧損約500萬元，惟未填寫營利事業所得基本稅額申報表，經本局依所得基本稅額條例規定計算該公司之基本所得額為2,500萬元(課稅所得負500萬元+證券交易所得3,000萬元)，予以補稅294萬元【(基本所得額2,500萬元-扣除額50萬) ×稅率12%】，並處罰鍰。
本局特別提醒營利事業，營利事業有列報證券(期貨)交易等所得，即使申報課稅所得為虧損，仍應依規定計算及申報所得基本稅額，以免遭補稅及處罰。營利事業如仍有不明瞭之處，歡迎至本局網站（網址為http://www.ntbna.gov.tw）查詢相關法令，或利用本局免費服務電話0800-000321洽詢，本局將竭誠提供詳細之諮詢服務。
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