高雄市稅捐處表示，合法登記的工廠，供直接生產使用的自有房屋，可申請減半課徵房屋稅。而依工廠管理輔導法第15條規定，廠房利用違章建築或違反建築物使用用途者，不得辦理工廠登記。因此，若利用違章建築作廠房使用，就無法申請減半課徵房屋稅。
該處舉例說明，某塑膠工廠因原有廠房不敷使用，而在已核准工廠登記的工廠圍牆內新建房屋供生產使用，惟未另向工務局申請建照執照及使用執照，則該新建房屋即屬違章建築，依上述工廠管理輔導法的規定，違章建築不得辦理工廠登記，自不符合「合法登記工廠」之要件，而無法申請減半課徵房屋稅。稅捐處籲請工廠興辦人應注意該項規定，以免喪失了減半課稅的權益。
