本局表示，營利事業列報投資損失雖提示清算證明文件，惟經查核未提示足資證明被投資事業實質營運虧損之證明文件，無法證明確有出資額折減事實，則不得列報為營利事業損失。
本局舉例說明，甲公司辦理101年度營利事業所得稅結算申報，列報投資損失160,000,000元，經國稅局以未提示足資證明被投資事業實質營運虧損之證明文件，遭剔除補稅。甲公司提起行政救濟，主張系爭投資損失係海外子公司A公司之清算損失，其已檢附A公司解散清算證明文件及A公司清算完結匯入款項，即應以實際投資成本減除清算後實際分配之金額認列投資損失等。經本局查核，以A公司係甲公司100%持股之子公司，從事海外投資控股業務，A公司再轉投資B公司為甲公司之孫公司，實質上運用甲公司之投資款產生之營運虧損為B公司，惟甲公司未能釐清系爭投資損失內容，無法證明A公司清算完結收回股款之計算依據，亦無法證明B公司有實質營運所產生之虧損，顯見A公司僅係形式上辦理解散清算，無法僅憑A公司銀行匯入款及清算文件，即可認定其列報之投資損失係屬真實，原核定否准認列並無不合，案經臺北高等行政法院判決駁回確定。
本局特別提醒，所得稅法及營利事業所得稅查核準則規範之投資損失，係以被投資事業實質發生營運虧損為限，並透過減資彌補虧損或解散清算方式，造成其出資額折減者，投資損失才算真正實現，並非僅檢附形式減資或清算文件即可認定，營利事業列報投資損失應特別注意，以免遭國稅局剔除補稅。
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